Были часто у меня подобные проблемы, когда конвертил. Искать приходилось ручками(удалял половину ipl-файла, потом, если вылетает - половину от половины, и т.д., иначе - другую половину и т.д.). Почти всегда были проблемы с объектами, прописанными в object.dat(ну т.е. имеющие физику) - бъющиеся стекла, скамейки и т.д. У них я просто не так флаги в ide выставлял.
Но это всё у меня было на Vice City, за SA не отвечаю. Да и вообще - я корявый конвертер, поэтому может и в Вайсе такая проблема была у меня одного.